RECORD DETAILS
Add Record To Cart - Printer-friendly version - Close Window| Chaperonin ID: | b34437 |
| Chaperonin Group: | I |
| Deposit Date: | 2019-05-24 |
| Type: | ref |
| Type strain?: | no |
| Genus: | Candidatus Phytoplasma |
| Species: | palmae |
| Strain: | Cocos nucifera phytoplasma |
| Lineage: | root; cellular organisms; Bacteria; Tenericutes; Mollicutes; Acholeplasmatales; Acholeplasmataceae; Candidatus Phytoplasma; 16SrIV (Coconut lethal yellows group) |
| Original ID: | - |
| CUTC ID: | - |
| Nucleotide Genbank Accession: | KY779619 |
| Peptide Genbank Accession: | - |
| Best FASTA Match: | - |
| Date of FASTA search: | - |
| FASTA identity %: | - |
| Best BLASTP Match: | - |
| Date of BLASTP search: | - |
| BLASTP identity %: | - |
| Source: | Genbank |
| Notes: | 16SrIV-A cpn60 IV-IA Florida USA. Host: coconut (Cocos nucifera) |
|
Full Nucleotide Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
ATGGCTAAAGAAATTCTTTTTGGAAAAGATGCTAGAAGAGAAATTTTAAAAGGTGTAAAT ATTTTAGCAAATACTGTTAAATCGACTTTAGGACCAAAAGGTACTAATGTTGTTTTACAA AAAAATGATTCTATTATTGCTTGTAATGATGGAGTTACAATAGCTAAAGAAATAGAATTA AAGAATCTTTATCAAAATATGGGTGCAAAATTAGTATGTGAAGCTGCTAGTAAAACTAAC GATAATGCTGGAGATGGGACTACTACTGCAACTGTTTTAGCTCAGTATATGATTAATAAA GGTTTTAAATTTGTTGAATCCGGTTCTAAAGCTGTTCTGCTTAGAGAAGGAATTTTAAAA GCTGCTGATTTAGTTGCTAAAAAACTTTTAGAAAAATCAAAACCTGTTGTAACGCAAGAG GATATTGAAAATATTGCTTCTATTTCTTCAGGACAAAAATCAATAGGTAAAATAATAGCC TCTGCTATGGAAAAGGTTACTAAAAAAGGTGTTATTAGTGTTGATGAATCTAAAGGTTTT GAAACAGAATTAGAAGTTGTTCAAGGGATGCAATATGATAAAGGTTATGTTTCACCTCAT TTTATTACTAATAAGGAAAATATGTCTATTGATTTAGAAAAAGTATCTATTTTAGTTACT GATCATAAAATAAATAATATACATGAAATTCGTTTTTTGTTAGAAGAAATAGTTAAATCT TCTATTCCTTTGTTAATTATTGCTGATTCTTTTGAAACAGATGTTATTAATTCTTTAGTT TTTAATAAAATAAGCGGAGTTTTTAATGTTGTTGCTACTGAAGCTCCAGGATTCGGAGAT AATCAAAAAGAATTACTGAAAGATATATGTGCTTTATCTAAAGCTACTTTTATATCTAAA GATTTAAATATGAAATTACAAGATGTTAATATGAAACATTTAGGACAAATTAATAAAGCA ATCGTTAAAAAAGATAACACAGTTTTAGTTGGTGATAACAAAACGGAATCTTTAATAGAA AGAATTAAAGAAATTGAATCACATATTAAAATAACAACTAATGATTATGATTTACAAAAT TTAAAATCTCGTTTAGCTAATTTATCTGGAGGAGTGGCAGTTATTAAAGTTGGTTCAATG ACTGAAGCTGAGTTAAAAGAACAAAAATTAAGAATTGAAGATGCTTTAAATGCTACTCAA GCTGCTTTAGATGAAGGTATATCTGTTGGTGGTGGAAAATCTTTAATTAATGTTTATAAA AATTTAAAAGATATTTTAAAAAATGATAATAGTGATATTCAAAAGGGAATGAATATTGTT TTAGAAAGTTTATTATCCCCTTCTTATCAAATTGCCGAGAATTCTGGTTTTGATGGAGAT ACTGTTGTAAAAAAACAATTAAAACAGAAAGAAGAAAGTTTTGGTTTTGATTCTAAAGAA GGTAAATATGTTGATTTAATCAAAAAAGGTATTATTGATCCTACTAAAGTTACTAGACAA GCGATTTTAAATTCTGCTTCAATTGCTTCTGTTATAATTACAACAGGAGCCGCTGTAGTT CCAGTTAAAGAACAATCTAATGATAGTGGTTGTTGTTCTTCTCCTATGATGGATTCTAAT TTTTTATAA |
|
Full Peptide Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
MAKEILFGKDARREILKGVNILANTVKSTLGPKGTNVVLQKNDSIIACNDGVTIAKEIEL KNLYQNMGAKLVCEAASKTNDNAGDGTTTATVLAQYMINKGFKFVESGSKAVLLREGILK AADLVAKKLLEKSKPVVTQEDIENIASISSGQKSIGKIIASAMEKVTKKGVISVDESKGF ETELEVVQGMQYDKGYVSPHFITNKENMSIDLEKVSILVTDHKINNIHEIRFLLEEIVKS SIPLLIIADSFETDVINSLVFNKISGVFNVVATEAPGFGDNQKELLKDICALSKATFISK DLNMKLQDVNMKHLGQINKAIVKKDNTVLVGDNKTESLIERIKEIESHIKITTNDYDLQN LKSRLANLSGGVAVIKVGSMTEAELKEQKLRIEDALNATQAALDEGISVGGGKSLINVYK NLKDILKNDNSDIQKGMNIVLESLLSPSYQIAENSGFDGDTVVKKQLKQKEESFGFDSKE GKYVDLIKKGIIDPTKVTRQAILNSASIASVIITTGAAVVPVKEQSNDSGCCSSPMMDSN FL |
|
Nucleotide UT Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
GCAACTGTTTTAGCTCAGTATATGATTAATAAAGGTTTTAAATTTGTTGAATCCGGTTCT AAAGCTGTTCTGCTTAGAGAAGGAATTTTAAAAGCTGCTGATTTAGTTGCTAAAAAACTT TTAGAAAAATCAAAACCTGTTGTAACGCAAGAGGATATTGAAAATATTGCTTCTATTTCT TCAGGACAAAAATCAATAGGTAAAATAATAGCCTCTGCTATGGAAAAGGTTACTAAAAAA GGTGTTATTAGTGTTGATGAATCTAAAGGTTTTGAAACAGAATTAGAAGTTGTTCAAGGG ATGCAATATGATAAAGGTTATGTTTCACCTCATTTTATTACTAATAAGGAAAATATGTCT ATTGATTTAGAAAAAGTATCTATTTTAGTTACTGATCATAAAATAAATAATATACATGAA ATTCGTTTTTTGTTAGAAGAAATAGTTAAATCTTCTATTCCTTTGTTAATTATTGCTGAT TCTTTTGAAACAGATGTTATTAATTCTTTAGTTTTTAATAAAATAAGCGGAGTTTTTAAT GTTGTTGCTACT |
|
Peptide UT Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
ATVLAQYMINKGFKFVESGSKAVLLREGILKAADLVAKKLLEKSKPVVTQEDIENIASIS SGQKSIGKIIASAMEKVTKKGVISVDESKGFETELEVVQGMQYDKGYVSPHFITNKENMS IDLEKVSILVTDHKINNIHEIRFLLEEIVKSSIPLLIIADSFETDVINSLVFNKISGVFN VVAT |