RECORD DETAILS
Add Record To Cart - Printer-friendly version - Close Window| Chaperonin ID: | b35242 |
| Chaperonin Group: | I |
| Deposit Date: | 2019-12-11 |
| Type: | ref |
| Type strain?: | no |
| Genus: | Candidatus Phytoplasma |
| Species: | pini |
| Strain: | MDPP |
| Lineage: | root; cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Tenericutes; Mollicutes; Acholeplasmatales; Acholeplasmataceae; Candidatus Phytoplasma; 16SrXI (Rice yellow dwarf group) |
| Original ID: | - |
| CUTC ID: | - |
| Nucleotide Genbank Accession: | VIAE01000001.1 |
| Peptide Genbank Accession: | TVY12419 |
| Best FASTA Match: | - |
| Date of FASTA search: | - |
| FASTA identity %: | - |
| Best BLASTP Match: | - |
| Date of BLASTP search: | - |
| BLASTP identity %: | - |
| Source: | Genbank |
| Notes: | cpn60 UT XXI-IB; 16SrXXI-B. Host: mountain pine tree; country of origin: USA (Maryland) |
|
Full Nucleotide Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
ATGGCTAAAAAGGTTATTTTTGGAAAAGAAGCTAGAAAAGAAATTTTAAAAGGCGTAAAT GCTTTAGCAGAAACAGTTAAAATTACTTTAGGTCCTAAGGGTAGTAATGTAGTTTTAGAA AAACCATATGAATCTCCTTCTATTATTAATGATGGGGTTTCTATTGCAAAAGAAATAGAA TTAAAAGATGCTTATCAAAATATGGGTGCTAAGTTGGTATGTGAAGCAGCTATAAAAACC AACGATGATGCAGGAGATGGCACAACAACAGCTACTATTTTAGCTCAAAATATGATTCAA AAAGGTTTTAAATTTATCAATTCAGGTTATAAAGCAGTTTCAATTAAAGAGGGTATTTTA AAAGCCTCTAAAGAAGTGGCTAAAAGACTTTTGGAAAAATCTAAACCAATAGAAACACAA GAAGATATTGAAAATGTCGCTTCTATCTCATCAGGCCAAAAAGAAATAGGCAAAATTATA GCTGATGCTATAGAAAAAGTAACAAAAAAAGGCGTTATTAGTGTTGATAAATCGCAAGGT TTTAAAACTGAATTAGAAGTAATTCAAGGTATGCAATATGATAAAGGCTATTTATCTCCT TATTTTGTTACTAATAAAGAAAATATGTCAGTAGAATTAGAACAAGCATCTATTTTAGTT ACTGATCATAAAATTAGCAATATTCAAGAAATTAGGCCTTTATTAGAAGATATAGTAAAA AATTCAACACCTTTATTAATTATTGCTGATTCATTGGAAAATGATGTTGTTAGTACTTTA ATTTTTAATAAAATGAGTGGTATTTTTAATATTGTAGCAACTGATGCACCAGGATTCGGC GATAATCAAAAAGATTTTCTTCAAGATATAGCAGCTTTAACACAAGCTACTTTTATTTCA AAAGATTTAAATATGAAATTACAAAATGTTAGAGCAGAGCATTTAGGCAAAATTAATAAA GCAATTGTTAAAAAAGATAAAACAGTTTTAATAGGCACTGAAAAAACAGAAATTTTAAAA AATAGAATTAAAGAAATAGAAATACATATTCAAAAAGCAACTAGTGATTATGAATTAAAA AATTTAAAAACACGTTTAGCTAAATTATCTGGTGGAATTGCAATTATAAAAGTTGGAGCA GCTACAGAAGCAGAATTAAAAGAACAAAAATTAAGAATTGAAGATGCTTTAAACGCTACT CAAGCAGCAATTGCTGAAGGTATTTTAGTCGGTGGCGGGAAAGCTTTTATTGAAATTTTT AATGATTTAAAAGATGAACTAAAAGATGAAAATTCTGATGTTCAAAAAGGAATTAATATT GTTTTAGATAGTTTGTTAATCCCTTCTTATCAAATTGCAGAAAATGCAGGTTTCGATGGT GATTCTGTGGTTAAAGAACAGTTAAAACAAAAAGAAAATTTTGGTTTTGATGCTAAAGAA GGAAAATATGTTGATTTATTGAAACAAGGAATTATTGATCCTACTAGAGTATTAAAACAA GCTATTTTAAATTCGTCTTCTATTGCTGCTATAATTATTACAACAGAAGCAGCTGTAGCG ACATTTAAAGATAAAAATAATGATAATATTTCTTCTTCGATGCCGAATCCTAATGCTTTA TAA |
|
Full Peptide Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
MAKKVIFGKEARKEILKGVNALAETVKITLGPKGSNVVLEKPYESPSIINDGVSIAKEIE LKDAYQNMGAKLVCEAAIKTNDDAGDGTTTATILAQNMIQKGFKFINSGYKAVSIKEGIL KASKEVAKRLLEKSKPIETQEDIENVASISSGQKEIGKIIADAIEKVTKKGVISVDKSQG FKTELEVIQGMQYDKGYLSPYFVTNKENMSVELEQASILVTDHKISNIQEIRPLLEDIVK NSTPLLIIADSLENDVVSTLIFNKMSGIFNIVATDAPGFGDNQKDFLQDIAALTQATFIS KDLNMKLQNVRAEHLGKINKAIVKKDKTVLIGTEKTEILKNRIKEIEIHIQKATSDYELK NLKTRLAKLSGGIAIIKVGAATEAELKEQKLRIEDALNATQAAIAEGILVGGGKAFIEIF NDLKDELKDENSDVQKGINIVLDSLLIPSYQIAENAGFDGDSVVKEQLKQKENFGFDAKE GKYVDLLKQGIIDPTRVLKQAILNSSSIAAIIITTEAAVATFKDKNNDNISSSMPNPNAL |
|
Nucleotide UT Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
GCTACTATTTTAGCTCAAAATATGATTCAAAAAGGTTTTAAATTTATCAATTCAGGTTAT AAAGCAGTTTCAATTAAAGAGGGTATTTTAAAAGCCTCTAAAGAAGTGGCTAAAAGACTT TTGGAAAAATCTAAACCAATAGAAACACAAGAAGATATTGAAAATGTCGCTTCTATCTCA TCAGGCCAAAAAGAAATAGGCAAAATTATAGCTGATGCTATAGAAAAAGTAACAAAAAAA GGCGTTATTAGTGTTGATAAATCGCAAGGTTTTAAAACTGAATTAGAAGTAATTCAAGGT ATGCAATATGATAAAGGCTATTTATCTCCTTATTTTGTTACTAATAAAGAAAATATGTCA GTAGAATTAGAACAAGCATCTATTTTAGTTACTGATCATAAAATTAGCAATATTCAAGAA ATTAGGCCTTTATTAGAAGATATAGTAAAAAATTCAACACCTTTATTAATTATTGCTGAT TCATTGGAAAATGATGTTGTTAGTACTTTAATTTTTAATAAAATGAGTGGTATTTTTAAT ATTGTAGCAACT |
|
Peptide UT Sequence: BLAST this sequence: cpnDB | |
ATILAQNMIQKGFKFINSGYKAVSIKEGILKASKEVAKRLLEKSKPIETQEDIENVASIS SGQKEIGKIIADAIEKVTKKGVISVDKSQGFKTELEVIQGMQYDKGYLSPYFVTNKENMS VELEQASILVTDHKISNIQEIRPLLEDIVKNSTPLLIIADSLENDVVSTLIFNKMSGIFN IVAT |